U svojoj dugoj povijesti Crkva Sv. Marije mijenjala je izgled i namjenu. Za vrijeme građanskih ratova i najezde Turaka prema Zagrebu, u Crkvi se nalazilo spremište oružja. Preuređenje u baroknom stilu započelo je 1740. godine, i to u nekoliko etapa kada Crkva dobiva vitki toranj. Kipovi na oltarima i reljef propovjedaonice radovi su ljubljanskog kipara i graditelja Franje Rottmana, a iluzionistička freska iza oltara slovenskih slikara, oca i sina Franca i Krištofa Jelovšeka.